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大尺度人類DNA精準(zhǔn)合成組裝與跨物種遞送實(shí)現(xiàn)


記者10日從天津大學(xué)獲悉,合成生物技術(shù)全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、該校合成生物與生物制造學(xué)院元英進(jìn)院士團(tuán)隊(duì)實(shí)現(xiàn)大尺度(兆堿基Mb)人類DNA的精準(zhǔn)合成組裝與跨物種遞送,研究成果于當(dāng)日發(fā)表在國際期刊《自然·方法》上。
自21世紀(jì)初“人類基因組計劃”完成人類染色體測序以來,研究人員便開始追求“從頭書寫”基因組的能力。但人類基因組的從頭設(shè)計與合成面臨兩大核心技術(shù)瓶頸,極大地限制了合成基因組學(xué)在高等生物中的應(yīng)用與發(fā)展。
元英進(jìn)團(tuán)隊(duì)最新的研究成果在上述兩個關(guān)鍵方面均取得了突破性進(jìn)展。其創(chuàng)新性地建立了名為SynNICE的技術(shù)體系。該體系首次在酵母中精準(zhǔn)組裝了包含大量重復(fù)序列的人類DNA大片段;創(chuàng)新性開發(fā)“酵母核載體”技術(shù),可完整提取并保存酵母細(xì)胞核內(nèi)DNA;成功將組裝好的人類DNA大片段導(dǎo)入小鼠早期胚胎,實(shí)驗(yàn)首次觀察到這些人工DNA片段在胚胎中被激活并產(chǎn)生調(diào)控基因表達(dá)的表觀遺傳標(biāo)記。
該研究針對人類Y染色體關(guān)鍵功能區(qū)——無精子癥因子a(AZFa),該區(qū)段的缺失會導(dǎo)致最嚴(yán)重的男性不育,通過手術(shù)獲得精子的概率幾乎為零。研究人員提出“組合式層級組裝策略”:利用酵母同源重組,通過三步逐級拼接方案,成功實(shí)現(xiàn)了這一復(fù)雜序列在釀酒酵母中的高效組裝。
團(tuán)隊(duì)突破性地開發(fā)完整酵母細(xì)胞核分離技術(shù),能夠提取直徑僅1微米的細(xì)胞核,不僅確保了核內(nèi)合成染色體不被降解,更維持了其染色質(zhì)高級結(jié)構(gòu)特征,利用該方法提出的酵母細(xì)胞核可冷凍保存6個月以上。此外,研究團(tuán)隊(duì)還通過顯微注射技術(shù),將合成基因組高效遞送至具有全能性分化潛能的小鼠早期胚胎,并首次觀察到合成基因組在早期胚胎四細(xì)胞階段啟動轉(zhuǎn)錄的現(xiàn)象。
這項(xiàng)研究在國際上實(shí)現(xiàn)了Mb尺度人類基因組的從頭合成組裝、跨物種轉(zhuǎn)移與功能重塑,是人類基因組合成和轉(zhuǎn)移技術(shù)的重要進(jìn)展,對合成人類基因組具有重要意義。(記者陳曦 通訊員趙暉)
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